针对“合同到期不续签，公司赔偿按应发工资计算”的问题，我们梳理了可能出现的法律风险点。1.补偿金数额不足风险：若公司按实发工资计算补偿金，会导致您实际获得的金额低于法定标准。例如：您应发工资为8000元月（含奖金1000元），实发工资为6500元（扣除社保、个税1500元），公司按6500元计算10个月补偿金为65000元，而法定应按8000元计算为80000元，差额15000元即您的经济损失。2.证据链缺失风险：若您未保留工资条或劳动合同，无法证明应发工资构成，仲裁时可能因证据不足无法获得全额补偿金。例如：公司主张您的应发工资仅包含基本工资5000元，而您无工资条证明包含奖金1000元，仲裁委可能采信公司主张，导致补偿金减少。
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针对“合同到期不续签，公司赔偿按应发工资计算”的问题，我们分析了可能影响处理的特殊情况。1.员工月工资高于当地职工月平均工资三倍：根据《劳动合同法》第四十七条，若您的月应发工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍，补偿金标准按该三倍数额计算，且支付年限最高不超过十二年。例如：当地职工月均工资为5000元，您应发工资为20000元（超过三倍15000元），则补偿金按15000元月计算，最长支付12年。2.员工同意按实发工资计算：若您与公司签订书面协议，明确同意按实发工资计算补偿金，该协议可能被认定为有效，您无法再主张按应发工资补足差额。例如：您因急于离职，与公司签订协议同意按实发工资6500元计算补偿金，后续再主张按8000元补足差额可能不被支持。
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对于“合同到期不续签，公司赔偿损失按应发工资计算”的结论，我们依据以下法律规定进行详细分析。根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条规定：“经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付……本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。”结合您的情况，合同到期不续签的经济补偿属于该条款调整范围，其中“月工资”明确指向应发工资（包含基本工资、奖金、津贴等所有应得项目），而非扣除社保、个税的实发工资。因此，公司应按您终止劳动合同前十二个月的平均应发工资计算赔偿金额。
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针对您提出的“合同到期不续签，公司赔偿损失是按应付工资结算，还是按实际工资赔偿”的问题，核心答案如下。公司赔偿损失一般按应发工资计算。1.若存在工资构成包含基本工资、奖金、津贴、补贴等项目的情况：补偿金计算基数需将这些应发项目全部纳入，即劳动合同解除或终止前十二个月的平均应发工资。2.若存在公司仅按实发工资（扣除社保、个税等后的金额）计算的情况：这种计算方式不符合法律规定，您有权要求按应发工资重新核算。

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